制药厂在生产产品的过程当中，面对不同类型的产品，需要保障不同洁净级别的生产环境标准，而不同洁净级别的生产环境标准主要的不同就是需要对生产环境的粒子数量以及微生物数量进行严格等级不同的检测和控制。
因此，工作人员需要采取各种方法来对洁净室进行消毒灭菌工作以达到标准要求，使用的消毒剂也是多种多样，现在市面上的杀孢子剂多种多样，制药厂需要找到一款适合自己的杀孢子剂，才能够对症下药，事半功倍。
下洁净区消毒灭菌常用消毒剂的优缺点：
1、酚类消毒剂
优点：
对分枝杆菌（结核杆菌）有效（其他的醇类和季铵盐类不具备）、广谱消毒剂，具有碱性或酸性配方（添加碱性成分的时候，酚类消毒剂会变成阴离子型表面活性剂，可以使酚类消毒剂具有良好的去污能力，在高有机物浓度下，依然不受有机物的干扰，能够发挥良好的杀灭效果）（欢迎免费注册，登陆中国涂料在线（涂料在线）行业门户网址www.coatingol.com，免费发布供求，免费发布产品，免费发布企业动态）。
局限：
不能杀孢子、有残留、使用不兼容化学品后活性受影响。
2、季铵盐类消毒剂
优点：
具有广谱活性（比酚类的略窄），杀菌剂毒性小，杀菌效率高，受 pH值变化的影响小，使用方便，化学性能稳定，分散作用及缓蚀作用好。
局限：
不能杀孢子，易受水硬度及有机物影响；长期单独使用，易产生抗药性,属低效消毒剂。
3、醇类（70%异丙醇杀菌性能、75%乙醇杀病毒性能）
优点：
无残留，广谱容易挥发，不能杀孢子。
局限：
清洁效果差，可燃（安全性巨大的隐患），接触时间有限（因为接触时间有限，所以杀灭能力偏低，只能覆盖到真菌孢子以下）。
4、杀孢子剂：
局限：腐蚀软金属和不锈钢，要求预先清洁，对温度和光敏感，可能产生氯气存在安全隐患，对眼睛和皮肤有腐蚀性。
过氧化氢，6%浓度的过氧化氢即具有杀灭孢子的作用，高效消毒剂，挥发速度快。
局限：需要较高的浓度，需要较长的接触时间，对软金属有腐蚀性，需要进行稀释，需要预先清洁，对温度敏感，对眼睛和皮肤有腐蚀性。
过氧化氢/过氧乙酸混合物，快速、广谱活性，可杀孢子，同效果相当的氧化剂相比腐蚀性小，对人员较安全，可自灭菌。
局限：对软金属有腐蚀性，需要预先清洁，对温度敏感，刺激性气味，为了提高混合物的稳定性可能会加入大量醋酸，浓缩型的混合物，在稀释后要尽快使用，避免效力大幅下降。
甲醛/乙醛，广谱活性（包括孢子)无腐蚀性，可以喷雾方式使用。
局限：需要激活，有机物存在时不稳定而会被灭活要求较长的接触时间，对人的安全性有影响，可能需要中和残留。需要注意的是杀孢子剂没有清洁作用。